大棚栽培厚皮甜瓜的主要病害有细菌性叶斑病、叶枯病、霜霉病、枯萎病、蔓枯病、病毒病等。

(1)细菌性叶斑病:甜瓜主要病害之一，病菌喜温暖、潮湿环境，田间湿度大时容易发病。一旦发病，蔓延迅速。症状：以危害叶片和茎蔓为主口发病初期，叶片病部出现水渍状斑点，扩大后受叶脉限制，呈多角形或不规则的褐色大斑，连片致叶片焦枯，有时在叶面、叶背或茎蔓患处有乳白色菌液流出。防治方法:选用抗病品种，轮作，深翻晒垡，施足基肥，及时清除病残老叶，增加棚内通风透光量，降低棚内湿度。在发病初期用77%可杀得可湿性粉剂800倍液，72%农用链霉素4000倍液、47%加瑞农可湿性粉剂800倍液、50%DT可湿性粉剂500倍液交替防治，5一7天1次，连续防治3-4次。

(2)叶枯病：真菌性病害，发病适温为25-32℃、相对湿度80%以上，高湿闷热时有利病害的发生与蔓延。症状：叶片、茎蔓和果实均可受害，以叶片受害最重。发病初期，叶片上呈水渍状褐色小点，逐渐扩大成深褐色圆形斑，稍凹陷，中心灰白色，且具有微轮纹，严重时叶片焦枯。茎蔓染病，产生菱形或椭圆形有稍凹陷的病斑。果实受害，果面出现圆形褐色的凹陷斑，常有裂纹口病菌可侵入果肉，造成果实腐烂。防治方法：高畦，地膜覆盖，加强温湿度调控和肥水管理。发病初期用70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，64%杀毒矾可湿性粉剂、70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液交替防治，5一7天1次，连续防治2一3次。

(3)厚皮甜瓜其他病害防治方法可参见黄瓜、西瓜的病害防治技术。

(4)厚皮甜瓜虫害有蚜虫、红蜘蛛、白粉虱、美洲斑潜蝇等，防治方法参见黄瓜虫害防治技术。