如何根据立体农业结构的特性，组装高效益的生产模式，是实践中经常碰到的问题。装配立体农业模式必须遵循以下原则：

组合各种结构要综合考虑模式内部的整体协调，使立体农业模式形成为一个整体性的系统。例如考虑五大结构中的任何一个时，要同时考虑其他四个结构；组配一个具有地形梯度的地域性立体布局时，农林牧副渔各业要形成一个有机的整体，同时要兼顾经济、社会、生态三大效益。如果单纯追求眼前的经济效益而盲目扩大种植比例，毁林开荒，从种植业局部看经济效益是大的，但从整体看，由于比例失调，整体功能将下降。